More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2545 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  81.01 
 
 		 261 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  77.91 
 
 		 261 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  77.13 
 
 		 261 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  66.67 
 
 		 256 aa  334  7.999999999999999e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  66.27 
 
 		 256 aa  332  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  64.71 
 
 		 256 aa  322  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  64.23 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  55.65 
 
 		 257 aa  294  1e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  56.28 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  55.73 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  58.89 
 
 		 254 aa  268  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  54.66 
 
 		 250 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  54.1 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  53.04 
 
 		 249 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  58.3 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  58.2 
 
 		 250 aa  256  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  56.92 
 
 		 254 aa  256  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  56.13 
 
 		 258 aa  255  5e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  53.97 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  54.94 
 
 		 258 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  52.4 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  54.92 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  53.23 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  51.03 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  48.77 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  39.43 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  41.04 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 		 243 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  34.38 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  33.2 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  34.54 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  30.63 
 
 		 275 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  32.05 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 331 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  29.92 
 
 		 265 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  41.88 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 270 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.89 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  44.14 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  30.8 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.67 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  29.5 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  34.3 
 
 		 334 aa  82  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  31.7 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  30.45 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  30.3 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  41.27 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  41.38 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 270 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  34.96 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  34.96 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  34.96 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  34.68 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  34.96 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  34.68 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0819  alpha/beta hydrolase fold  37.58 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  38.4 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  29.39 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.09 
 
 		 350 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  29.15 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  35.25 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2926  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.557091  normal  0.933948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  35.16 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1865  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7714  alpha/beta hydrolase fold protein  39.57 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0886  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  35.95 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  35.15 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  40.65 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>