More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1411 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  100 
 
 
251 aa  502  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  64.34 
 
 
250 aa  286  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  46.43 
 
 
257 aa  198  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  42.4 
 
 
272 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 
264 aa  139  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  33.98 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
261 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
268 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  35.22 
 
 
258 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
250 aa  104  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 
261 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
262 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  35.06 
 
 
248 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  31.3 
 
 
256 aa  100  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
257 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  30.89 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
250 aa  99  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  34.38 
 
 
261 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
254 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.73 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  30.28 
 
 
249 aa  95.5  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 
254 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
250 aa  90.1  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  29.75 
 
 
255 aa  89  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
258 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 
250 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
250 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  27.85 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.82 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  33.47 
 
 
275 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1809  non-heme chloroperoxidase  29.57 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308788  normal  0.0377897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  38.32 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  41.07 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  23.6 
 
 
270 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  35.45 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  28.78 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  27.52 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  30.89 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5600  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
324 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350573  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4854  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395513  normal  0.376362 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
277 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5209  Alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
273 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3458  Alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.419988  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
278 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5816  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
324 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.953252  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
271 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
273 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3996  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
277 aa  58.5  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
425 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  25.75 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  21.65 
 
 
286 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1605  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
334 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.695033  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  35.58 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  26.76 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  29.3 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 
294 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.69 
 
 
262 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3450  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
284 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
297 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  28 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5197  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
275 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747018 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  28.84 
 
 
278 aa  55.8  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
282 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
273 aa  55.5  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3745  Alpha/beta hydrolase  26.01 
 
 
280 aa  55.5  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.173154  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  26.7 
 
 
272 aa  55.5  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.15 
 
 
284 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.48 
 
 
273 aa  55.5  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  33.49 
 
 
352 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2279  non-heme chloroperoxidase  27.2 
 
 
322 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.294789  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  30.28 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  25.42 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>