More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3146 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  76.4 
 
 		 250 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  77.2 
 
 		 250 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  76.4 
 
 		 250 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  73.09 
 
 		 249 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  78.8 
 
 		 250 aa  377  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  74.9 
 
 		 251 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  60.57 
 
 		 261 aa  291  6e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  56.47 
 
 		 255 aa  291  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  58.66 
 
 		 254 aa  288  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  58.27 
 
 		 254 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  53.6 
 
 		 250 aa  272  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  52.55 
 
 		 255 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  56.28 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  56.28 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  53.63 
 
 		 261 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  53.23 
 
 		 261 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  55.73 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  51.97 
 
 		 254 aa  254  7e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  49.42 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  50.8 
 
 		 251 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  53.25 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  50.78 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  46.56 
 
 		 257 aa  240  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  44.72 
 
 		 248 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  37.02 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  37.12 
 
 		 243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 		 246 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  30.12 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  29.63 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  27.76 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  41.13 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 250 aa  79  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.6 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  43.86 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  29.96 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  41.53 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  41.03 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.47 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.71 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  34 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 278 aa  73.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0261  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.812291  normal  0.698005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.57 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.21 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 284 aa  72.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.21 
 
 		 368 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  26.69 
 
 		 275 aa  72  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 		 284 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  39.66 
 
 		 281 aa  72  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  27.66 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.38 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  37.82 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  26.98 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  25.73 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  33.63 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.1 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  33.63 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  33.63 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  33.63 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  34.51 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  26.32 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  34.75 
 
 		 262 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  33.63 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  36.15 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>