More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3240 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  40.17 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  37.65 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  39.41 
 
 		 261 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  38.06 
 
 		 275 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  39.33 
 
 		 261 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  36.29 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  38.4 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  37.93 
 
 		 256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  35.46 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  34.06 
 
 		 249 aa  125  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  37.4 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  34.32 
 
 		 257 aa  123  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  36.16 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  36.76 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  38.2 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  34.2 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 		 264 aa  89  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  35.02 
 
 		 272 aa  88.6  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  34.03 
 
 		 262 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  42.15 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  47.22 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1865  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  37.5 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  31.58 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  31.14 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  33.92 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  41.9 
 
 		 311 aa  72  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 314 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  33.15 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.8 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  28.08 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.82 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  42.59 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.64 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  37.9 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  41.41 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0146  alpha/beta hydrolase fold protein  43.14 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1917  alpha/beta hydrolase fold protein  44.14 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  35.83 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  26.71 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.44 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  31 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  36.36 
 
 		 270 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  37.6 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  40 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 331 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 		 309 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  29.95 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  36.13 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  35.04 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 		 351 aa  65.9  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  36.13 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 343 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>