More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1681 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
273 aa  555  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  85.87 
 
 
272 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  30.89 
 
 
290 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
265 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.57 
 
 
262 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  29.84 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 
265 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  31.1 
 
 
259 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  26.44 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  26.44 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  27.59 
 
 
270 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
259 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
292 aa  92.8  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  28.69 
 
 
270 aa  92.8  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.79 
 
 
270 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.44 
 
 
270 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
275 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  26.44 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
269 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
273 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
253 aa  90.1  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
270 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
295 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  26.05 
 
 
270 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
280 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 
271 aa  88.6  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  28.69 
 
 
270 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 
267 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
270 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 
350 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 
359 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 
264 aa  87  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.22 
 
 
425 aa  87  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
265 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  28.79 
 
 
268 aa  85.9  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.38 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.38 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  29.34 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  38.32 
 
 
341 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.28 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
270 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  30.62 
 
 
425 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  32.3 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.36 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  26.09 
 
 
373 aa  82.4  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  26.77 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
270 aa  82.4  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  38.94 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 
289 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.07 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.48 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 
263 aa  81.6  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  29.46 
 
 
262 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.22 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3081  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0542902  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2839  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
267 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.39297 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.17 
 
 
371 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
289 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
291 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>