More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3917 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  80.08 
 
 		 250 aa  407  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  78.09 
 
 		 250 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  74.9 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  69.32 
 
 		 250 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  69.2 
 
 		 249 aa  364  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  70.52 
 
 		 250 aa  344  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  58.43 
 
 		 254 aa  289  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  58.04 
 
 		 254 aa  288  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  55.47 
 
 		 255 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  56.57 
 
 		 250 aa  285  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  60.08 
 
 		 261 aa  285  4e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  56.47 
 
 		 254 aa  275  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  56.45 
 
 		 256 aa  274  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  56.05 
 
 		 256 aa  272  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  56.22 
 
 		 261 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  52.33 
 
 		 257 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  51.56 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  55.42 
 
 		 261 aa  263  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  56.56 
 
 		 256 aa  258  7e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  53.28 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  58.3 
 
 		 261 aa  256  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  52.59 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  53.28 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  49.6 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  43.72 
 
 		 250 aa  191  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  38.89 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  30.93 
 
 		 246 aa  99.4  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  30.27 
 
 		 251 aa  95.5  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 270 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  27.91 
 
 		 275 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 370 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  29.72 
 
 		 281 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.47 
 
 		 370 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.9 
 
 		 286 aa  85.5  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  30.81 
 
 		 373 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 264 aa  85.1  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  27.8 
 
 		 275 aa  85.1  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  26.75 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.07 
 
 		 279 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  27.88 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  30.16 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  28.05 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 266 aa  82  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  28.75 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.62 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  31.25 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  28.36 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.67 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.91 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2258  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.40096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.28 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.17 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.02 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  35.66 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  28.83 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  29.39 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27.15 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  34.76 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.59 
 
 		 293 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  41.28 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 		 284 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  37.01 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  35.54 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.95 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>