More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3209 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
250 aa  503  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  60.63 
 
 
254 aa  304  7e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  60.24 
 
 
254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  59.22 
 
 
255 aa  295  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  56.42 
 
 
257 aa  294  9e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  58.14 
 
 
258 aa  288  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  58.14 
 
 
258 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  55.6 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  55.42 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  54 
 
 
250 aa  279  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  55.2 
 
 
250 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  53.6 
 
 
250 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  56.57 
 
 
251 aa  271  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  53.94 
 
 
254 aa  271  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  57.96 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  56 
 
 
250 aa  268  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  55.6 
 
 
255 aa  268  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  51.42 
 
 
257 aa  259  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  54.66 
 
 
261 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  54.4 
 
 
251 aa  255  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  50 
 
 
256 aa  248  8e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  49.6 
 
 
256 aa  247  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  52.63 
 
 
261 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  51 
 
 
256 aa  241  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  54.92 
 
 
261 aa  239  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 
248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 
250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  37.85 
 
 
258 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  35.74 
 
 
243 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 
264 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  31.96 
 
 
251 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 
262 aa  99  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  32.8 
 
 
272 aa  95.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 
268 aa  95.1  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  40.52 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  40.52 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  40.52 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  40.52 
 
 
270 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  39.66 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  40.52 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  39.66 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  40.52 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  29.63 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  39.66 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  29.59 
 
 
296 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  29.26 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  29.26 
 
 
296 aa  78.6  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  32.04 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  30.13 
 
 
235 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  28.49 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  43.36 
 
 
284 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.29 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.54 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  30.36 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  40.5 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  28.81 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  27.83 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
335 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3171  alpha/beta hydrolase fold protein  37.4 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3745  putative hydrolase  27.83 
 
 
224 aa  72.4  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 
284 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.84 
 
 
279 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
283 aa  72  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4936  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000404482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.14 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3028  alpha/beta hydrolase fold protein  42.99 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.821303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  35.16 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.17 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3265  Alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.279729  normal  0.0341286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10564  peroxidase bpoC (non-haem peroxidase)  29.27 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0807819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0621  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  30.47 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  27.84 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  25.7 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
297 aa  68.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  41.35 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12958  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  40 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3804  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
294 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  29.22 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
281 aa  68.6  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
272 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  39.68 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2901  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0641701  normal  0.105734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.03 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  31.22 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>