More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1565 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 363 aa  733    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.55 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 		 273 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2671  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 		 310 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.22 
 
 		 312 aa  94  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 339 aa  92.8  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 312 aa  92.8  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 288 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 291 aa  92  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.27 
 
 		 273 aa  90.5  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0523777 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 278 aa  90.5  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 287 aa  90.5  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 309 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.57 
 
 		 313 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 298 aa  90.5  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 317 aa  89.7  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24.75 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 272 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  27.4 
 
 		 286 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 268 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  25.94 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 312 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0107  Alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 286 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.84 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 286 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0299  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 343 aa  87  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 266 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 272 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.24 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 279 aa  86.3  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 315 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 288 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 291 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5013  carboxylesterase Na  28.78 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  28.11 
 
 		 289 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 291 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 282 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 278 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 300 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  29.79 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  28.98 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  28.78 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3997  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3995  chloroperoxidase precursor  28.27 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  28.78 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  28.57 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  30.77 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 276 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  30.99 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  29.26 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2407  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5410  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.459598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.12 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1380  3-oxoadipate enol-lactonase  28.01 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.595814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  27.11 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4343  3-oxoadipate enol-lactonase  28.01 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149189  normal  0.0581646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0764  alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4742  alpha/beta hydrolase fold  26.57 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 		 278 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>