More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3601 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
264 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  32.79 
 
 
251 aa  139  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
257 aa  119  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  34.12 
 
 
261 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
268 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  32.56 
 
 
258 aa  117  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 
250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
268 aa  112  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
272 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  30.95 
 
 
256 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  30.95 
 
 
256 aa  106  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
250 aa  106  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
255 aa  105  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
256 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 
250 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  33.6 
 
 
254 aa  102  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
254 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 
262 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
254 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 
261 aa  96.3  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
257 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  32.16 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
251 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
250 aa  92.4  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  27.59 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.69 
 
 
257 aa  91.3  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 
250 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  31.36 
 
 
249 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
250 aa  89.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.08 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.5 
 
 
262 aa  85.5  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
250 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  29.25 
 
 
281 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
271 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.34 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.8 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
270 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
226 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  26.81 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  27.82 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  26.69 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  43.69 
 
 
294 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27.82 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.32 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  29.14 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
425 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0086  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0069  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 
279 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.55127e-28 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
270 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 
254 aa  72  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2090  bromoperoxidase  28.21 
 
 
278 aa  72  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 
234 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.57 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3150  bromoperoxidase  28.11 
 
 
278 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.908823  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  28.89 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0635  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
286 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0650  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  23.4 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
344 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3158  bromoperoxidase  28.21 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00429075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  28.51 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.86 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4478  Alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
272 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.785695  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
289 aa  69.3  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
280 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2941  bromoperoxidase  27.86 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2915  arylesterase (aryl-ester hydrolase)  27.86 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3173  bromoperoxidase  27.86 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>