More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2666 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 257 aa  511  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  46.43 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  46.72 
 
 		 250 aa  198  9e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  40.53 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  40.39 
 
 		 272 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  34.89 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 		 254 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  35.62 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  35.6 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  34.7 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  34.05 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 250 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  32 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  31.6 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  33.6 
 
 		 258 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 261 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 		 268 aa  92  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  32.44 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  33.49 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  32.78 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.07 
 
 		 262 aa  68.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  29.72 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.66 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  24.44 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 353 aa  62  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  27.08 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1199  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00792158  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7597  non-heme chloroperoxidase  31.27 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  40.86 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  40.86 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 		 314 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0671  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5598  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  37.96 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3157  alpha/beta hydrolase fold  27.1 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  31.78 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  36.52 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  35.24 
 
 		 229 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  27.56 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 276 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5814  alpha/beta hydrolase fold  39.68 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.086599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  44.94 
 
 		 292 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  46.15 
 
 		 275 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  23.29 
 
 		 286 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 352 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2195  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 297 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131585  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  36.18 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6522  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6756  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 302 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.216165  normal  0.0313623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  36.36 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  40.19 
 
 		 294 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 		 284 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6345  alpha/beta hydrolase fold  33.08 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  35.45 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 250 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7032  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137031  normal  0.207733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  29.72 
 
 		 277 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 		 276 aa  52  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 345 aa  52  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 331 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  42.7 
 
 		 291 aa  52  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  28.69 
 
 		 302 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 307 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1463  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.879851  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>