More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4208 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 268 aa  525  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  52.96 
 
 		 259 aa  261  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  55.69 
 
 		 265 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  55.28 
 
 		 265 aa  248  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  52.19 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  49.03 
 
 		 265 aa  239  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  50.2 
 
 		 263 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  51 
 
 		 272 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  52.19 
 
 		 326 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  44.57 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  45.98 
 
 		 310 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  45.06 
 
 		 315 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  41.56 
 
 		 279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  41.13 
 
 		 261 aa  172  6.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  40.08 
 
 		 310 aa  168  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  42.8 
 
 		 276 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 		 287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  39.55 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  40.52 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  41.83 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  41.2 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  36.8 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  36.18 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 280 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  30.65 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  34.54 
 
 		 282 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.96 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 283 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  33.73 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 		 279 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  24.59 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.9 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  40.68 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4021  alpha/beta hydrolase fold  29.26 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.425727  normal  0.727928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 		 425 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  28.35 
 
 		 234 aa  72  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 		 271 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  25.22 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  28.63 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  30.32 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.01 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  36.04 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0165  bioH protein  29.04 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3988  carboxylesterase bioH  29.04 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3748  carboxylesterase bioH  29.04 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.23 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2191  hydrolase  21.8 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000799459  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  27.39 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  27.61 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  23.96 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0269  alpha/beta fold family hydrolase  28.93 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.699859  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37050  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.53 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.557179 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0125  hydrolase  28.43 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.577709  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.54 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  43.36 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5527  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.563792  normal  0.509486 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4731  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  28.83 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  24.8 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>