More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1299 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  539  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  51.98 
 
 
284 aa  280  1e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.466438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  50.39 
 
 
279 aa  271  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  47.83 
 
 
261 aa  249  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  49.34 
 
 
287 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  45.3 
 
 
273 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  39.38 
 
 
284 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  39 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 
284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 
270 aa  208  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1788  alpha/beta hydrolase fold protein  34.19 
 
 
279 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0842408  hitchhiker  0.00140329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  34.35 
 
 
310 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
276 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1790  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
287 aa  139  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.333084  hitchhiker  0.00365614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2639  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
280 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2684  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
280 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9064  normal  0.0215233 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 
326 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2668  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
280 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.105125  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
259 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  32.92 
 
 
263 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
268 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  32.37 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  30.32 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
323 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0737  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 
273 aa  119  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.755425  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
265 aa  118  7.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
327 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3606  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
265 aa  115  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1509  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
261 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.725835  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5863  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 
265 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.279453 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1106  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 
283 aa  99  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.112481  normal  0.804859 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
280 aa  98.6  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.43 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  30.49 
 
 
286 aa  95.5  7e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
277 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1534  lipolytic enzyme  28.38 
 
 
294 aa  92.4  7e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.277395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
425 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 
282 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  25.51 
 
 
296 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.39 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  24.7 
 
 
296 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  24.7 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  28.43 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  28.43 
 
 
233 aa  85.9  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3027  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  24.29 
 
 
296 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1367  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.819345  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
255 aa  79  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  25.4 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5863  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.648074  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2555  alpha/beta hydrolase fold protein  23.36 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.249679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1470  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
278 aa  75.5  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0099  alpha/beta fold family hydrolase  25.45 
 
 
220 aa  75.5  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000675213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  22.31 
 
 
267 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  23.46 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  25.33 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  25 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  27.8 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  25.66 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0977  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  23.68 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.245429  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
250 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  21.79 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  26.36 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.02 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  22.88 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.98 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  22.92 
 
 
277 aa  68.9  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  23.53 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5717  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6081  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  23.5 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2375  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2477  Alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  25.63 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7870  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645188  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.02 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  23.53 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  22.48 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  25.11 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  25.97 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0908  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000766289  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6565  alpha/beta hydrolase fold  24.68 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.250077 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  23.62 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>