More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4183 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 279 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  47.64 
 
 		 277 aa  251  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  44.4 
 
 		 293 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  46.26 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  44.68 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  44.68 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  44.68 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  43.24 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  43.32 
 
 		 284 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  42.6 
 
 		 294 aa  214  9e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  43.4 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  44.4 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  42.34 
 
 		 289 aa  212  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  42.64 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  41.94 
 
 		 295 aa  208  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  40.65 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1186  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4- dienoate hydrolase (BphD)  45.42 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.644621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  40.89 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  40.53 
 
 		 289 aa  202  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  40 
 
 		 289 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  44.66 
 
 		 286 aa  202  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  38.16 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  40.81 
 
 		 298 aa  198  7e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  40.44 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.26 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  38.26 
 
 		 288 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.26 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.26 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  40.3 
 
 		 275 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.26 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  38.26 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  38.26 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  37.13 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  37.36 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  36.67 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  39.1 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  34.7 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  35.79 
 
 		 273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 		 289 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  36 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 		 286 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 		 304 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5690  Alpha/beta hydrolase fold  34.06 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 285 aa  158  9e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  35.32 
 
 		 271 aa  158  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1513  Alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  31.9 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 273 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  34.53 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0210  alpha/beta hydrolase fold  34.42 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  31.77 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2894  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3884  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.330831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  32.4 
 
 		 299 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0888  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.797798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 291 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  28.17 
 
 		 279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 275 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 296 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4719  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 		 282 aa  108  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 345 aa  103  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0068  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>