More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0925 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  66.27 
 
 
255 aa  362  3e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  62.35 
 
 
254 aa  313  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  62.75 
 
 
254 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  58.43 
 
 
254 aa  298  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  55.69 
 
 
250 aa  295  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3209  alpha/beta hydrolase fold  59.22 
 
 
250 aa  295  3e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0445  alpha/beta hydrolase fold  57.59 
 
 
257 aa  296  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  56.08 
 
 
250 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  58.14 
 
 
258 aa  291  7e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  56.47 
 
 
250 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0409  alpha/beta hydrolase fold protein  58.46 
 
 
258 aa  290  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  56.3 
 
 
249 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
250 aa  280  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3917  alpha/beta hydrolase fold  55.47 
 
 
251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.827272  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2581  alpha/beta hydrolase fold  54.9 
 
 
250 aa  272  3e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.624662  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  54.4 
 
 
261 aa  265  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1112  alpha/beta hydrolase fold  54.18 
 
 
261 aa  262  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.64134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  53.73 
 
 
251 aa  258  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  53.2 
 
 
261 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_004310  BR1264  alpha/beta fold family hydrolase  53.33 
 
 
256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1226  alpha/beta fold family hydrolase  52.55 
 
 
256 aa  249  3e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0832  hydrolase, alpha/beta fold family protein  49.6 
 
 
257 aa  245  6e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.100419  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2545  hydrolase  52.4 
 
 
261 aa  236  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1925  alpha/beta hydrolase fold  52.99 
 
 
256 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2612  alpha/beta hydrolase fold  45.82 
 
 
250 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.899373  normal  0.0292589 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  42.23 
 
 
248 aa  185  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07970  lysophospholipase  40.6 
 
 
258 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3240  alpha/beta hydrolase fold protein  35.89 
 
 
243 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0962986  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4138  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 
268 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.511306  normal  0.651356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4204  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 
262 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3601  alpha/beta hydrolase fold protein  32.75 
 
 
264 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.229176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4204  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
272 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.723787  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7519  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 
246 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1649  hypothetical protein  33.62 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal  0.10741 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1411  alpha/beta hydrolase  29.75 
 
 
251 aa  89  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.731043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2714  alpha/beta hydrolase fold protein  46.6 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216364  normal  0.0171077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2300  putative hydrolase protein  31.17 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000890498 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2567  putative hydrolase protein  29.15 
 
 
275 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.230369  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  31.22 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2666  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
257 aa  82  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
273 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  32.63 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 
267 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  35.25 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  29.62 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.33 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1675  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
301 aa  78.6  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0263497  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.63 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
284 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5604  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0455  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
363 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  29.75 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4384  alpha/beta hydrolase fold protein  27.47 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.944451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  38.74 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.3 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
331 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 
271 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 
297 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.58 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 
318 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.598088  hitchhiker  0.00401352 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.04 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.87 
 
 
293 aa  72  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5414  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
261 aa  72  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6846  Alpha/beta hydrolase  36.92 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.525505 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5437  alpha/beta hydrolase fold  30.73 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204018  hitchhiker  0.00818802 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
328 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  37.96 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.19 
 
 
370 aa  71.2  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2292  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.288944 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0585  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474837  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0351  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.825015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1064  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  28.27 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  27.08 
 
 
281 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2181  alpha/beta hydrolase fold  30.09 
 
 
273 aa  70.5  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0974  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.2 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3019  putative hydrolase  30.26 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.757431  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  36.67 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.54 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  39.02 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.62 
 
 
370 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2025  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 
276 aa  69.3  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  36.15 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  27.44 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>