More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4502 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
353 aa  693    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  79.38 
 
 
325 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  71.74 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  71.43 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  71.43 
 
 
318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  58.16 
 
 
299 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  41.36 
 
 
352 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  35.5 
 
 
299 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  36.9 
 
 
347 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  35.74 
 
 
312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.14 
 
 
390 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
350 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  34.89 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  32.7 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  33.12 
 
 
364 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.75 
 
 
330 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
369 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
369 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
369 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
362 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
306 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
423 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
362 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
306 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  32.05 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 
325 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 
360 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
400 aa  90.1  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.74 
 
 
296 aa  89.7  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 
364 aa  85.9  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  38.75 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  32.16 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  28.53 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  31.03 
 
 
260 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  29.39 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
364 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  28.53 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  29.73 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 
331 aa  79.3  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  28.83 
 
 
271 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
299 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  31.35 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
267 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  30.4 
 
 
258 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3331  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0127235  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  29.03 
 
 
263 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  29.2 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  29.03 
 
 
261 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  24.18 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  28.11 
 
 
279 aa  72.8  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  29.67 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  28.37 
 
 
263 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
264 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.67 
 
 
320 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.6 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0160  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
284 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.94 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  28.22 
 
 
270 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.42 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  27.36 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  32.21 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  28.25 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.77 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  22.34 
 
 
271 aa  69.3  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4391  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 
618 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.21601 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 
265 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28 
 
 
260 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  28.22 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0950  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
272 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4910  short chain dehydrogenase  35.48 
 
 
595 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.96 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0923  alpha/beta hydrolase fold protein  27.59 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  48.84 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 
595 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4071  alpha/beta hydrolase fold  44.76 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  40.83 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
254 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  27.87 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>