More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6555 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 366 aa  725    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  59.09 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  44.82 
 
 		 364 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40.06 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  39.78 
 
 		 400 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 423 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  43.93 
 
 		 421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  39.35 
 
 		 390 aa  212  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 362 aa  212  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 369 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  43.62 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  38.67 
 
 		 373 aa  205  8e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  40.18 
 
 		 360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  40.25 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  41.37 
 
 		 344 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  38.91 
 
 		 364 aa  182  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  38.08 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 389 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 349 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  38.11 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  37.03 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  39.02 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  39.14 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  46.39 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  34.73 
 
 		 312 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 318 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  33.12 
 
 		 318 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  32.31 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  30.61 
 
 		 299 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 		 299 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  31.18 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 		 265 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5312  non-heme chloroperoxidase  26.25 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.66387 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  26.77 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 273 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3177  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 273 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0955063  normal  0.862905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 363 aa  66.2  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.737323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  38.52 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  27.83 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 271 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.97 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.86 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  25.75 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.74 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  27.82 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.05 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.07 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.41 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  26.99 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.74 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  26.64 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.07 
 
 		 368 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  22.1 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4606  alpha/beta hydrolase fold  22.87 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4915  hydrolase, alpha/beta fold family  22.53 
 
 		 269 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.07 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  25.24 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  24.92 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 352 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3897  alpha/beta hydrolase fold protein  26.28 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0275193  normal  0.323769 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.24 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0343  hydrolase, alpha/beta fold family  22.53 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2970  transcriptional regulator, CadC  31.01 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  26.92 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>