More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2011 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  595  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40.82 
 
 
263 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  35.61 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.02 
 
 
265 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
269 aa  87.4  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  29.23 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  28.87 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  42.74 
 
 
270 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  42.74 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
270 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  32.41 
 
 
263 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
269 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2731  hydrolase, alpha/beta fold family  32.31 
 
 
258 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  45.36 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  28.68 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
302 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  43.56 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  39.05 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  28.72 
 
 
494 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  31.88 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1118  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  27.59 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  34.82 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
291 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  25.62 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  38.73 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  31.23 
 
 
278 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  34.21 
 
 
286 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  36.7 
 
 
462 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 
278 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 
336 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  33.09 
 
 
233 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  36.7 
 
 
462 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  33.09 
 
 
233 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4462  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 
277 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  25.36 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.35 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  41.58 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  22.18 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
278 aa  65.9  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9382  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
279 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  26.25 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.8 
 
 
263 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  28.26 
 
 
372 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  37.69 
 
 
276 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0879  alpha/beta fold family hydrolase  28.89 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.889021  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 
254 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.29 
 
 
350 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4064  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
283 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 
277 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1435  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
256 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.426403  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 
271 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
324 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  30.45 
 
 
258 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5301  putative oxidoreductase protein  29.55 
 
 
258 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0102616  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  23.96 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
321 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 
270 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  31.8 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.04 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
264 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 
335 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
333 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  36.21 
 
 
256 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
265 aa  62.4  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
275 aa  62.8  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
256 aa  62.8  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 
267 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  37 
 
 
453 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  44.58 
 
 
275 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 
294 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  39.81 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  26.37 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
246 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>