More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3856 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 364 aa  725    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  91.76 
 
 		 364 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  46.48 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  41.34 
 
 		 423 aa  206  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  37.05 
 
 		 369 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  40.47 
 
 		 421 aa  202  8e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  37.65 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  37.42 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  38.53 
 
 		 366 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 360 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  34.28 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 362 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  38.48 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.11 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  37.95 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 325 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  34.57 
 
 		 348 aa  139  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  31.88 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.74 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  41.67 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 		 306 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 		 352 aa  113  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  36.65 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  31.36 
 
 		 347 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  32.35 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1865  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0853648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  33.12 
 
 		 312 aa  92.8  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 333 aa  90.1  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  32.04 
 
 		 298 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 287 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5284  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.09 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.64 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.21 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.64 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 258 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 		 301 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.01 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.23 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0185  Alpha/beta hydrolase  27.27 
 
 		 280 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 279 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  24.41 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  27.46 
 
 		 275 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2396  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 290 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  26.35 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.52 
 
 		 297 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 363 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.15 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  23.91 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  23.91 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  23.91 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.79 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  23.91 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3404  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  23.91 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  27.62 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 381 aa  69.3  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4821  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  23.57 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  28 
 
 		 293 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  24.67 
 
 		 279 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  24.41 
 
 		 279 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  27.4 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 300 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>