More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0879 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0879  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 349 aa  686    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1174  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.326598  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1147  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.255082  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1164  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 369 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.428268 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4933  alpha/beta hydrolase fold  43.08 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1485  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 		 362 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.409347  normal  0.569371 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1712  alpha/beta hydrolase fold protein  39.37 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4461  alpha/beta hydrolase fold protein  39.63 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  42.61 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1191  alpha/beta hydrolase fold protein  37.22 
 
 		 400 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0625  alpha/beta hydrolase fold  37.29 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6555  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 366 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.38332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04600  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.46 
 
 		 330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.374511 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4266  alpha/beta hydrolase fold protein  35.56 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0560  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.747431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3466  alpha/beta hydrolase fold protein  37 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0901  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6010  alpha/beta hydrolase fold  35.95 
 
 		 421 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773155  normal  0.16375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0541  alpha/beta hydrolase fold protein  36.16 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.271487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6786  alpha/beta hydrolase fold  44.07 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0254  alpha/beta hydrolase fold protein  33.55 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  36.97 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3856  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 364 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775297  normal  0.514851 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5476  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294136  normal  0.797092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3629  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 306 aa  119  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030304  hitchhiker  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0991  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 389 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.750053  hitchhiker  0.00638838 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1497  alpha/beta hydrolase fold protein  35.03 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3387  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06710  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.54 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3656  alpha/beta hydrolase fold protein  32.47 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4246  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.146629  hitchhiker  0.00549727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0777  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.515072  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  32.21 
 
 		 312 aa  90.1  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4827  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 352 aa  86.3  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.692638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  35.78 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  40.52 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  29.68 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3171  proline iminopeptidase  27.83 
 
 		 298 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4028  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  30.2 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  31.43 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0457  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  34.86 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  28.15 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  38.46 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2381  putative non-heme chloroperoxidase  26.3 
 
 		 273 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2004  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.914633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  28.07 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.44 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.17 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  28.4 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1087  alpha/beta hydrolase fold  24.5 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0532953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3626  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  27.33 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  32.23 
 
 		 462 aa  57  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  33.33 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  37.61 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4822  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4502  alpha/beta hydrolase fold  34.33 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1713  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2642  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 340 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 276 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  37.17 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  27.68 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 		 229 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 296 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  35.34 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2717  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.572547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  38.32 
 
 		 568 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  34.69 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>