More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2554 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 294 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  96.6 
 
 		 294 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  79.18 
 
 		 296 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  79.18 
 
 		 296 aa  488  1e-137  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  78.84 
 
 		 296 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  78.16 
 
 		 296 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  77.82 
 
 		 296 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  78.16 
 
 		 296 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  80.55 
 
 		 296 aa  479  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  77.13 
 
 		 296 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  77.13 
 
 		 300 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  77.13 
 
 		 340 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  77.13 
 
 		 296 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  77.13 
 
 		 296 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  77.13 
 
 		 349 aa  480  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  76.45 
 
 		 296 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  76.79 
 
 		 296 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  79.25 
 
 		 302 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  62.76 
 
 		 305 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  62.33 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  63.82 
 
 		 297 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  62.76 
 
 		 307 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  61.3 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  51.01 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 		 311 aa  278  7e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  49.34 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  49.83 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  49.5 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 		 295 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  47.24 
 
 		 289 aa  265  7e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  43.45 
 
 		 343 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 		 307 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  46.92 
 
 		 300 aa  258  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  50.7 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  48.1 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 		 325 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  34.44 
 
 		 285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 		 289 aa  142  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 327 aa  142  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  31.65 
 
 		 290 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  36.12 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 288 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 288 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  26.44 
 
 		 2762 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  29.53 
 
 		 288 aa  99  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  26.28 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  26.28 
 
 		 282 aa  93.2  4e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 294 aa  92.8  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  30.36 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 		 299 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  38.13 
 
 		 298 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  32.91 
 
 		 289 aa  85.1  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29.82 
 
 		 284 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  27.96 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  26.4 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  25.61 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.1 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  26.64 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  34.08 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 474 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.32 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4294  alpha/beta hydrolase fold protein  32.31 
 
 		 286 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  33.13 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  37.62 
 
 		 590 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  24.5 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  41.35 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  24.85 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  25.33 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>