More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1732 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 297 aa  614  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  58.54 
 
 		 306 aa  349  3e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  50.87 
 
 		 291 aa  309  4e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  51.75 
 
 		 288 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  52.45 
 
 		 288 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  51.05 
 
 		 288 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  51.05 
 
 		 288 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  51.4 
 
 		 288 aa  296  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  50.35 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 		 288 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  48.95 
 
 		 298 aa  291  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 		 288 aa  291  8e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  50.35 
 
 		 288 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  47.59 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  46.23 
 
 		 311 aa  275  9e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  41.29 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  34.17 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  32.89 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 		 284 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  33.8 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  32.53 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  33.78 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 284 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 287 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  33.45 
 
 		 284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  31.36 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  31.33 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  33.45 
 
 		 284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  29.15 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  31.29 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  31.29 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  32.4 
 
 		 286 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  32 
 
 		 286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  34.64 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  30.74 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  28.38 
 
 		 359 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  31.12 
 
 		 244 aa  102  9e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  25.44 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  25.86 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  25.32 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  26.9 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.44 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  27.72 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  22.67 
 
 		 2762 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.35 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  27.09 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  27.76 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 311 aa  68.9  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  23.86 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  27.4 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  28.25 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  23.43 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  25.19 
 
 		 3045 aa  62.4  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5048  alpha/beta hydrolase fold protein  25.52 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.614525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4319  Alpha/beta hydrolase fold  28.48 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  24.7 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1498  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.219289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.08 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3435  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.898623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2432  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 253 aa  53.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>