More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3251 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 292 aa  584  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  43.51 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  36.39 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  36.39 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  36.39 
 
 		 296 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  36.77 
 
 		 305 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  36.39 
 
 		 300 aa  158  9e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  36.39 
 
 		 340 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  36.39 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  36.82 
 
 		 349 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 		 305 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  36.11 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  34.35 
 
 		 296 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  36.59 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  32.39 
 
 		 299 aa  142  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 296 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 296 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  33.91 
 
 		 296 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 		 294 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  34.39 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  34.49 
 
 		 296 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  33.9 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 311 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  33.77 
 
 		 312 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  33.78 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  32.65 
 
 		 311 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 289 aa  119  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 295 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  30.82 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 339 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 359 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 289 aa  89.7  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  24.74 
 
 		 282 aa  88.2  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  24.74 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.3 
 
 		 2762 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  27.04 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  21.93 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  37.9 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  39.62 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  37.7 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  27.46 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  37.19 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  30.29 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.93 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  37.82 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  28.8 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 283 aa  65.5  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  35.71 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  36.67 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  25.47 
 
 		 284 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  32.74 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  32.74 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  32.74 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  27.27 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  32.74 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 260 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  27.27 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  24.56 
 
 		 275 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>