More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1760 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  83.33 
 
 
288 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  83.68 
 
 
288 aa  511  1e-144  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  83.33 
 
 
288 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  83.33 
 
 
288 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  82.29 
 
 
288 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  82.64 
 
 
288 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  82.64 
 
 
288 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  78.12 
 
 
288 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  61.72 
 
 
298 aa  381  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  61.77 
 
 
294 aa  363  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  61.7 
 
 
291 aa  358  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  52.13 
 
 
311 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  51.4 
 
 
297 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  49.83 
 
 
306 aa  292  4e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  50.66 
 
 
311 aa  275  4e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 
315 aa  180  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  36.79 
 
 
279 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  35.02 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  34.66 
 
 
282 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 
306 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  34.04 
 
 
300 aa  151  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  32.96 
 
 
289 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
284 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  34.84 
 
 
284 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  34.84 
 
 
308 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  34.49 
 
 
284 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 
284 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
284 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  32.86 
 
 
284 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  34.84 
 
 
284 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 
284 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  29.2 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
294 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  31.69 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  36.78 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  33.86 
 
 
286 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  29.69 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  33.46 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  32.52 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  30.45 
 
 
299 aa  126  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  34.55 
 
 
244 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  32.34 
 
 
289 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  28 
 
 
359 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.53 
 
 
2762 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 
308 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
289 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
295 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 
308 aa  92  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  30.31 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  30.08 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
308 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  29.77 
 
 
289 aa  89.4  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 
285 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
327 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  34.4 
 
 
312 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
289 aa  85.5  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 
311 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
294 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
311 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  26.9 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
300 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  32.32 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  36 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  27.09 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  26.9 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  27.53 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  25.8 
 
 
280 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  26.4 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  25.74 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  27.98 
 
 
360 aa  69.7  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  38 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 
325 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
297 aa  65.9  0.0000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
272 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>