More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0079 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  100 
 
 		 291 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  68.79 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  45.49 
 
 		 295 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4995  alpha/beta hydrolase fold protein  50.71 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  42.6 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2616  alpha/beta hydrolase fold protein  44.52 
 
 		 287 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  40.12 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  40.12 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  27.34 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  37.69 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  28.84 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  25.82 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  25.82 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  29.71 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  29.17 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  40.19 
 
 		 282 aa  71.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 278 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  41.82 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.95 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  43.88 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3201  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0736141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  24.72 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  38.52 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2776  lipase  22.36 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000301548 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2519  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 243 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.54258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 		 387 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4611  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  36.64 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2175  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.823265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  35.51 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  30.95 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 		 254 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  37.19 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2549  lipase  21.74 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  37.07 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3243  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  36.3 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 275 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2954  hydrolase  29.6 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000251178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2890  hydrolase  28.8 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  34.01 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  39.06 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  32.2 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  39.83 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  29.6 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  31.31 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  29.6 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  41.73 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  37.41 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2129  alpha/beta hydrolase fold protein  40.59 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  38.89 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  41.73 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  41.73 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  41.73 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  41.73 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  40.78 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  41.73 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  29.6 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  41.73 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  38.84 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 		 300 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  41.73 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>