More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2582 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 		 288 aa  594  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  88.19 
 
 		 288 aa  537  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  87.5 
 
 		 288 aa  533  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  87.5 
 
 		 288 aa  533  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  79.44 
 
 		 288 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  79.09 
 
 		 288 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  79.09 
 
 		 288 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  78.75 
 
 		 288 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  78.12 
 
 		 288 aa  486  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  65.52 
 
 		 298 aa  387  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  64.85 
 
 		 294 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  64.06 
 
 		 291 aa  367  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  52.46 
 
 		 311 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  52.45 
 
 		 297 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  52.38 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  48.34 
 
 		 311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 		 315 aa  189  5e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  36.07 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  36.75 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  36.62 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  32.85 
 
 		 282 aa  156  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  32.85 
 
 		 282 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  35.21 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  33.69 
 
 		 284 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 294 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  32.54 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  30.04 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  32.98 
 
 		 284 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  31.94 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  33.33 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  35.43 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  35.04 
 
 		 286 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 284 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  31.83 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  37.26 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  30.98 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  32.87 
 
 		 284 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  33.2 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  35.04 
 
 		 289 aa  122  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  29.5 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.82 
 
 		 2762 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  31.39 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 296 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  27.59 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.96 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  30.82 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  26.8 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 340 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  27.87 
 
 		 349 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  29.27 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  29.62 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  26.32 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.22 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 280 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  25.48 
 
 		 299 aa  72  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  35.45 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  30.32 
 
 		 3045 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  23.92 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4199  bioH protein  30.52 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 280 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>