More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A2186 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
296 aa  597  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  99.32 
 
 
349 aa  593  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  99.66 
 
 
300 aa  594  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  99.66 
 
 
340 aa  594  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  99.66 
 
 
296 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  99.66 
 
 
296 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  99.66 
 
 
296 aa  593  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  95.61 
 
 
296 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  86.15 
 
 
296 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  86.82 
 
 
296 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  85.81 
 
 
296 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  85.81 
 
 
296 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  85.47 
 
 
296 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  85.47 
 
 
296 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  86.15 
 
 
296 aa  501  1e-141  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  80.89 
 
 
302 aa  472  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  76.79 
 
 
294 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  76.45 
 
 
294 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  65.17 
 
 
305 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  64.48 
 
 
305 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  64.95 
 
 
297 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  65.17 
 
 
307 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  64.85 
 
 
297 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  50.68 
 
 
312 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  50.68 
 
 
299 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  51.51 
 
 
311 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  51.34 
 
 
311 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  47.56 
 
 
309 aa  266  4e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 
313 aa  265  8e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  45.82 
 
 
295 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  47.14 
 
 
300 aa  250  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
343 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  47.19 
 
 
325 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  48.47 
 
 
307 aa  245  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
289 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  49.65 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  46.02 
 
 
309 aa  225  7e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  36.39 
 
 
292 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  35.91 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  34.92 
 
 
300 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  35.35 
 
 
289 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  33.45 
 
 
285 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
327 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 
289 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  31.65 
 
 
290 aa  119  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 
359 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  28.38 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  28.04 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  32.24 
 
 
2762 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  26.8 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
288 aa  86.7  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  30.23 
 
 
284 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  26.87 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  29.77 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
294 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  28.57 
 
 
284 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
360 aa  73.6  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.09 
 
 
284 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  23.89 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  38.53 
 
 
590 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
282 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  30.59 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  31.05 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  24.49 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  27.86 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  24.58 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 
239 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
287 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  29.94 
 
 
297 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  30.66 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  36.07 
 
 
297 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0771  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>