More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2459 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  75.35 
 
 		 286 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  75 
 
 		 286 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  72.95 
 
 		 300 aa  408  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  68.99 
 
 		 284 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  68.66 
 
 		 284 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  66.9 
 
 		 284 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  67.61 
 
 		 284 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  67.25 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  67.25 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 		 284 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  38.63 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  34.45 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 284 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  40.46 
 
 		 306 aa  168  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  40.22 
 
 		 308 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  35.79 
 
 		 294 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  35.94 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 		 288 aa  166  5e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  36.02 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  35.63 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  40.98 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  37.15 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  41.33 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 		 308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  36.98 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  35.09 
 
 		 288 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  32.71 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 288 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  33.57 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.96 
 
 		 279 aa  145  9e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 306 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  36.02 
 
 		 244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  35.6 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  31.34 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  30.48 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  31.94 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  28.52 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.64 
 
 		 2762 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  32.53 
 
 		 284 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  30.63 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  32.23 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.34 
 
 		 327 aa  82  0.000000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  43.27 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  33.73 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  41.8 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  31.93 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  29.5 
 
 		 3045 aa  68.9  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.46 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  24.63 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.52 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  41.07 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  34.31 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  34.31 
 
 		 349 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  34.31 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  34.31 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  34.31 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  35.82 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  34.31 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  34.31 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>