More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0363 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
295 aa  607  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  48.5 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  47.67 
 
 
305 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  47.02 
 
 
305 aa  267  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  46.82 
 
 
296 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  46.82 
 
 
296 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  46.82 
 
 
296 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  44.71 
 
 
300 aa  261  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  46.15 
 
 
296 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  46.15 
 
 
296 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  46.15 
 
 
340 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  46.15 
 
 
296 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  46.15 
 
 
300 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  46.15 
 
 
349 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  46.82 
 
 
296 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  46.82 
 
 
296 aa  259  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
296 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  45.82 
 
 
296 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  45.15 
 
 
296 aa  255  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
289 aa  255  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1062  alpha/beta hydrolase fold  46.64 
 
 
297 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00192187  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  47.83 
 
 
307 aa  252  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  47.02 
 
 
294 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 
294 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  47.02 
 
 
302 aa  248  9e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
296 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  42.02 
 
 
312 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2699  alpha/beta hydrolase  41.1 
 
 
299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1153  alpha/beta hydrolase fold  44.81 
 
 
307 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 
311 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  40.72 
 
 
311 aa  203  4e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  40.26 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
309 aa  198  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1074  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
313 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253414  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1767  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 
339 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00963183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  38.92 
 
 
325 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1589  alpha/beta hydrolase fold  37.43 
 
 
343 aa  192  8e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
300 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  32.75 
 
 
285 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
289 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
327 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 
292 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  27.46 
 
 
2762 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
291 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  26.16 
 
 
288 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  99  8e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  25.83 
 
 
288 aa  99  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
288 aa  99  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
288 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  27.06 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
288 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.62 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
288 aa  96.7  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
298 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
294 aa  92.4  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
359 aa  92.4  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  27.34 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  27.93 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  27.8 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.3 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  37.69 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  24.59 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  27.46 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  26.75 
 
 
308 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  28.76 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
308 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  26.94 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  27.78 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  28.34 
 
 
289 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  23.69 
 
 
299 aa  70.1  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  23.72 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  25.72 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
324 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  26.72 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  27.46 
 
 
387 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  26.32 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  27.39 
 
 
289 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  25.25 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>