More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3651 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  100 
 
 
286 aa  566  1e-160  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  98.6 
 
 
286 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  75.35 
 
 
287 aa  441  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  71.23 
 
 
284 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  72.89 
 
 
300 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  66.32 
 
 
284 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  66.32 
 
 
284 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  68.66 
 
 
284 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  67.61 
 
 
284 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  67.61 
 
 
284 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 
284 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  39.19 
 
 
299 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
284 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  44.91 
 
 
289 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  35.48 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  35.02 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  36.49 
 
 
315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 
306 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
294 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  40.44 
 
 
308 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
288 aa  160  3e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  35.79 
 
 
288 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  39.11 
 
 
308 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  39.11 
 
 
308 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
288 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
288 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  31.32 
 
 
283 aa  154  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  35.49 
 
 
294 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
288 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  36.69 
 
 
311 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  35.21 
 
 
279 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
288 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 
291 aa  149  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
288 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
288 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  34.83 
 
 
298 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
306 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  34.25 
 
 
359 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  37.45 
 
 
244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  31.13 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  29.7 
 
 
308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  32.1 
 
 
284 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
297 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  29.32 
 
 
289 aa  128  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29.63 
 
 
284 aa  125  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  32.42 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.91 
 
 
2762 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  33.02 
 
 
289 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.93 
 
 
285 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 
300 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2246  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.1275  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  31.27 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2756  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 
290 aa  72.8  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  30.12 
 
 
3045 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  31.22 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  40.19 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  28.86 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 
340 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  28.86 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  30.89 
 
 
295 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 
288 aa  67  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
290 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  28.97 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4804  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
325 aa  66.6  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  28.43 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2529  putative hydrolase  44 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0887671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
290 aa  65.5  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  43.52 
 
 
297 aa  65.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2772  putative hydrolase protein  33.33 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>