More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3301 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  94.48 
 
 		 308 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  94.81 
 
 		 308 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2967  alpha/beta hydrolase fold  84.74 
 
 		 308 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.594676 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2459  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.664427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  41.54 
 
 		 300 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  37.78 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  40.08 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  39.68 
 
 		 286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  38.15 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  39.57 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  39.57 
 
 		 284 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  37.78 
 
 		 284 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2124  alpha/beta hydrolase fold  33.91 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321379 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  30.82 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  30.82 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3992  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  29.53 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2470  alpha/beta hydrolase  36.14 
 
 		 289 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.890486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  33.21 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2387  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 288 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0869571  normal  0.603358 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2178  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.100362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2255  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 288 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.170585  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2582  alpha/beta fold family hydrolase  31.6 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  29.66 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45778  predicted protein  29.84 
 
 		 359 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2429  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0133787  normal  0.21299 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1863  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.164632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1897  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0651937  normal  0.589442 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1890  alpha/beta hydrolase fold  30.21 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0538139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  29.64 
 
 		 2762 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1187  putative lipase  27.21 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0231247  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2449  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21931  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004091  predicted hydrolase/acyltransferase  29.6 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1592  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  89.7  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03843  hydrolase  31.25 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2109  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139583  normal  0.535795 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1935  alpha/beta fold family hydrolase  30 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1571  hypothetical protein  29.12 
 
 		 284 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0811227  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01378  hypothetical protein  29.3 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 		 327 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0907  putative hydrolase  27.34 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2189  alpha/beta hydrolase fold  32.37 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113055  hitchhiker  0.000974583 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.47 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1624  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.142246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1732  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.259687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  39.81 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  29.59 
 
 		 3045 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  35.19 
 
 		 275 aa  66.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  38.61 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  36.59 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  28.92 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  23.49 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  23.97 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2011  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000219515 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.22 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2128  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  28.09 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0413  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  25.54 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  28.08 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1267  alpha/beta fold family hydrolase  36.75 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1135  putative hydrolase protein  27.24 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  26.9 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  25.17 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  25.82 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  21.89 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>