More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1333 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  100 
 
 		 295 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  38.7 
 
 		 294 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  36.64 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  38.23 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  34.59 
 
 		 322 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  34.69 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 307 aa  142  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  33.01 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 318 aa  102  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 278 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43540  putative hydrolase  30.87 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  30.87 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  24.66 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  25 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3251  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0874027  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.74 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1764  alpha/beta hydrolase fold  34.4 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718391  normal  0.0637777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  27.19 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5458  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.306625  normal  0.0166355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  26.64 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4082  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.98 
 
 		 265 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0191  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  24.35 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2526  alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 		 275 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  35.78 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  33.96 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37370  predicted protein  28.36 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.273183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2567  alpha/beta fold family hydrolase  28.87 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3148  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1408  hypothetical protein  22.11 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2975  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3301  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  37.93 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 		 284 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 		 281 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  27.68 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  25.56 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4112  alpha/beta hydrolase fold  22.82 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000359232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  22.27 
 
 		 279 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  38.32 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0119  alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1699  putative hydrolase  38.54 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.81 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  31.85 
 
 		 300 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  29.34 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 404 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0714  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0301539  normal  0.0245198 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.33 
 
 		 368 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4202  epoxide hydrolase  27.95 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0534  putative peroxidase  25.61 
 
 		 281 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.476086  normal  0.88579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01136  hydrolase, alpha/beta fold family protein  26.15 
 
 		 279 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  33.06 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  28.41 
 
 		 298 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  36.17 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.19 
 
 		 368 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 273 aa  53.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  38.21 
 
 		 371 aa  53.1  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 		 269 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  33.06 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  35.48 
 
 		 283 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 255 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0849  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  41.84 
 
 		 263 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>