More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1744 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1744  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 318 aa  630  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 		 282 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  38.27 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2022  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.560184  normal  0.215859 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2541  alpha/beta hydrolase fold  32.74 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0266  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0256  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0276  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.984165  normal  0.165849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1333  hypothetical protein  30.28 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.44 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  27.68 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  24.22 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 		 299 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4953  alpha/beta hydrolase fold  28.33 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  27.55 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.83 
 
 		 308 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4321  alpha/beta hydrolase fold  24.19 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0798376 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3346  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3625  alpha/beta hydrolase fold  30.69 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1299  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  28.1 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1822  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0693506  normal  0.197549 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  21.89 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  23.94 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  23.49 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  21.55 
 
 		 287 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.38 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  24.43 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 273 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  32.82 
 
 		 321 aa  58.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  24.79 
 
 		 246 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0829  alpha/beta hydrolase fold  24.64 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.41609  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2992  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.772268  normal  0.459259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  25 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  22.93 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  32.73 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  21.8 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  24.8 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0704  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.166516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  21.56 
 
 		 571 aa  55.8  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  31.29 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.9 
 
 		 265 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  24.31 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  24.31 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2482  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 264 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  23.78 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  24.26 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  23.58 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  24.26 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 		 340 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  21.86 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  40.43 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  24.06 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  24.34 
 
 		 264 aa  55.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2929  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.912564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  35.78 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  24.43 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0537  dihydrolipoamide acetyltransferase, putative  30.91 
 
 		 292 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.169084  normal  0.40861 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  24.43 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  25.87 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 229 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  22.44 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  31.82 
 
 		 275 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  24.43 
 
 		 279 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  34.83 
 
 		 284 aa  53.9  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>