More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5259 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 288 aa  579  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  49.45 
 
 		 290 aa  239  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 291 aa  231  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  44.41 
 
 		 292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  43.98 
 
 		 285 aa  217  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  44.96 
 
 		 302 aa  215  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  45.63 
 
 		 294 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  43.84 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  43.43 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  45.62 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  44.36 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 		 296 aa  198  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  44.09 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  44.09 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  44.09 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  44.13 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  42.96 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  41.35 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  42.4 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  43.15 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 		 280 aa  178  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  41.16 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  38.49 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  40.08 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  32.62 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  34.2 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  34.1 
 
 		 298 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  33.72 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  32.66 
 
 		 309 aa  86.3  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.89 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 		 289 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  34.03 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  25.09 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.63 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  33.61 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  25.81 
 
 		 327 aa  77  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.72 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  30.84 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  25.31 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  25 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  29.24 
 
 		 279 aa  72.8  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  30.56 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  24.21 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  26.41 
 
 		 230 aa  72  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000642463  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  31.28 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  28.57 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  27.84 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  28.51 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  24.27 
 
 		 607 aa  65.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000295645  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000635452  unclonable  0.000004336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  24.23 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  24.71 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.11 
 
 		 2762 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  24.71 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1273  Alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.879726  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000406984  decreased coverage  0.00000741326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  26.84 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.61 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.31361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>