More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1368 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  100 
 
 
304 aa  620  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  92.43 
 
 
304 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  74.91 
 
 
306 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  67.7 
 
 
297 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  67.7 
 
 
298 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  67.7 
 
 
298 aa  411  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  68.17 
 
 
298 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  67.82 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  67.82 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  67.82 
 
 
298 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  67.66 
 
 
378 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  67.66 
 
 
325 aa  394  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  67.66 
 
 
448 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  67.66 
 
 
448 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  67.33 
 
 
448 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  67.33 
 
 
421 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  67.66 
 
 
448 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  69.42 
 
 
301 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  60.48 
 
 
294 aa  367  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  58.95 
 
 
323 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  58.95 
 
 
289 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  61.25 
 
 
293 aa  344  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  58.6 
 
 
289 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  49.28 
 
 
626 aa  298  1e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  51.94 
 
 
284 aa  292  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  48.2 
 
 
607 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  49.83 
 
 
296 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  45.54 
 
 
306 aa  265  5e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  50.88 
 
 
300 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  47.54 
 
 
330 aa  263  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  46.6 
 
 
299 aa  261  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  45.34 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  47.06 
 
 
323 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  47.86 
 
 
311 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  47.86 
 
 
311 aa  255  7e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  44.13 
 
 
319 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  45.52 
 
 
292 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  42.48 
 
 
309 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  40.64 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 
302 aa  228  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 
312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
286 aa  218  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  38.6 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  40.35 
 
 
279 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  39.3 
 
 
300 aa  195  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  30.48 
 
 
284 aa  177  3e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  31.54 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  34.74 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  35.49 
 
 
292 aa  147  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
292 aa  144  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  28.99 
 
 
285 aa  144  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  36.33 
 
 
284 aa  138  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 
290 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  32.13 
 
 
305 aa  132  9e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  34.64 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  34.82 
 
 
297 aa  127  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  32.89 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  33.2 
 
 
295 aa  116  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  32.34 
 
 
274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  34.43 
 
 
275 aa  110  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  31.97 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 
290 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  31.46 
 
 
308 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  32.24 
 
 
298 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
298 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
307 aa  105  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  31.6 
 
 
274 aa  105  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
307 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  29.53 
 
 
277 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 
290 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  26.48 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  25.87 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  25.91 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  35.82 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
295 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  24.75 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  25.52 
 
 
272 aa  64.3  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
290 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  33.62 
 
 
359 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
289 aa  63.2  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  28.52 
 
 
293 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  26.2 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  24.05 
 
 
258 aa  62.4  0.000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>