More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0065 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
312 aa  628  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  60.63 
 
 
302 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  45.63 
 
 
323 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  43.17 
 
 
287 aa  246  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  43.79 
 
 
294 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  49.63 
 
 
286 aa  229  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 
330 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  41.99 
 
 
283 aa  228  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  43.1 
 
 
306 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  42.2 
 
 
284 aa  228  8e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  46.5 
 
 
300 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  47.14 
 
 
279 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  43.57 
 
 
298 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  43.53 
 
 
297 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  42.66 
 
 
323 aa  221  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  42.07 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  45.27 
 
 
311 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 
309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  43.94 
 
 
306 aa  219  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  43.93 
 
 
296 aa  217  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  43.36 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  45.26 
 
 
311 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  42.5 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  42.5 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  43.71 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  42.5 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  41.46 
 
 
298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  42.35 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  38.95 
 
 
626 aa  208  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  42.07 
 
 
293 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  42.5 
 
 
301 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  41.05 
 
 
325 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  41.05 
 
 
378 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  43.3 
 
 
292 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  41.05 
 
 
448 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  41.05 
 
 
421 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  41.05 
 
 
448 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  39.93 
 
 
607 aa  203  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  41.05 
 
 
448 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  41.72 
 
 
304 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  40.7 
 
 
448 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  36.99 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  35.79 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  41.2 
 
 
319 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  33.58 
 
 
284 aa  189  4e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  34.21 
 
 
283 aa  186  3e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  38.59 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  40.65 
 
 
292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  40.29 
 
 
292 aa  162  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  33.7 
 
 
285 aa  155  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  39.7 
 
 
302 aa  153  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  36.95 
 
 
297 aa  134  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  32.69 
 
 
305 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  35.89 
 
 
292 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  34.89 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  33.69 
 
 
290 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  33.33 
 
 
274 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  34.6 
 
 
295 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  33.57 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
282 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 
274 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
290 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 
290 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  35.48 
 
 
274 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
307 aa  102  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
307 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 
308 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 
298 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  31.85 
 
 
277 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
300 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.34 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  31.33 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
298 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
275 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  29.28 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.78 
 
 
271 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  27.97 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
289 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.9 
 
 
290 aa  67  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  28.06 
 
 
298 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
330 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3284  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
267 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 
285 aa  64.7  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
289 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
305 aa  65.1  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>