More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2557 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  69.55 
 
 		 295 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  68.99 
 
 		 292 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  69.34 
 
 		 292 aa  401  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  39.26 
 
 		 323 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  41.79 
 
 		 286 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  37.42 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 		 284 aa  162  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  39.76 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 		 311 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  38.78 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  39.64 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.28 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  33.22 
 
 		 300 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  35.4 
 
 		 298 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  37.59 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  41.11 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  34.36 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  36.57 
 
 		 296 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  35.05 
 
 		 298 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  38.76 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.33 
 
 		 285 aa  136  5e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  35.05 
 
 		 298 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  34.35 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  35.33 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 283 aa  133  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  32.67 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 309 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  33.67 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 		 274 aa  122  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  31.1 
 
 		 607 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  31.56 
 
 		 626 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  27.47 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  35.61 
 
 		 290 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  34.85 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  34.04 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  34.77 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  36.65 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  33.11 
 
 		 448 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  32.31 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  27.67 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 		 448 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 		 448 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 		 448 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  32.77 
 
 		 421 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 290 aa  109  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 		 274 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 290 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 299 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  31.38 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  33.2 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  30.58 
 
 		 295 aa  97.4  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  33.82 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 		 298 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  30.48 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 308 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  30.33 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  30.61 
 
 		 288 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 265 aa  67  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28.15 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  28.84 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1648  alpha/beta hydrolase fold protein  27.53 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2383  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  31.02 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.38703  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  27.17 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.48 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>