More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2766 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  100 
 
 
293 aa  591  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  61.25 
 
 
303 aa  352  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7311  Alpha/beta hydrolase  50.87 
 
 
303 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.602855  normal  0.723346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1777  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
291 aa  258  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0284717 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  46.79 
 
 
285 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  46.74 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
290 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  45.91 
 
 
312 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  45.91 
 
 
312 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  45.91 
 
 
312 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 
303 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  44.95 
 
 
292 aa  231  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 
303 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  47.06 
 
 
303 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  43.36 
 
 
294 aa  228  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  46.3 
 
 
290 aa  226  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  45.17 
 
 
296 aa  225  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  47.76 
 
 
280 aa  225  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  45.45 
 
 
301 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  45.27 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  43.99 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  44.86 
 
 
299 aa  219  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4458  alpha/beta hydrolase fold  44.28 
 
 
302 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5311  alpha/beta hydrolase fold  47.33 
 
 
285 aa  215  9e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.106317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13510  peroxidase bpoA (non-haem peroxidase)  45.07 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  42.29 
 
 
302 aa  209  5e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  44.36 
 
 
288 aa  208  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  44.14 
 
 
294 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  43.86 
 
 
286 aa  202  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  41.26 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  38.76 
 
 
272 aa  166  5e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0890  flavin reductase-like, FMN-binding  33.09 
 
 
408 aa  122  8e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5377  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
298 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5466  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
298 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0306241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5753  alpha/beta hydrolase fold  31.72 
 
 
298 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.766272  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0865  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 
326 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
299 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
327 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  29.55 
 
 
305 aa  86.3  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  29.62 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  28.42 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 
289 aa  85.9  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
300 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  29.12 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
267 aa  79  0.00000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  25.3 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10044  hydrolase  27.61 
 
 
298 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  25.76 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  25 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  25.66 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
289 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  28.84 
 
 
296 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  28.28 
 
 
299 aa  72.4  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.46 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  23.64 
 
 
626 aa  71.2  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  24.03 
 
 
607 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
307 aa  70.1  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  27 
 
 
311 aa  70.5  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  27.45 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 
264 aa  68.6  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  25.69 
 
 
2762 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
311 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  23.17 
 
 
283 aa  67  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  26.27 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  23.44 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2094  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.672457  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
293 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  43.3 
 
 
272 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0492  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 
313 aa  63.5  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
278 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  24.39 
 
 
296 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 
271 aa  63.2  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
250 aa  63.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  28.52 
 
 
304 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  29.05 
 
 
298 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  24.91 
 
 
253 aa  62.4  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 
289 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
290 aa  62.4  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
264 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0037  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
261 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>