More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1245 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 290 aa  570  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  53.98 
 
 		 307 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  57.14 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  44.13 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  39.46 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  38.81 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 		 298 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  37.23 
 
 		 277 aa  155  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 		 299 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  37.99 
 
 		 274 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  37.18 
 
 		 274 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 307 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  38.63 
 
 		 275 aa  145  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  36.92 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  30.65 
 
 		 607 aa  140  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 284 aa  135  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  33.45 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  33.8 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 294 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  29.75 
 
 		 626 aa  129  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 300 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 		 287 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  31.85 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  35.82 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 330 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  31.8 
 
 		 300 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  32.54 
 
 		 296 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  28.9 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  32.59 
 
 		 289 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 308 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  30.77 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 		 448 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 		 448 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  33.96 
 
 		 448 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  32.13 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  33.58 
 
 		 448 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  33.58 
 
 		 421 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  32.23 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 309 aa  115  6e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  33.82 
 
 		 301 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  32.08 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 292 aa  112  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  32.42 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 		 306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 292 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  32.08 
 
 		 299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  25.3 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  30.08 
 
 		 304 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 312 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  32.73 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  30.86 
 
 		 305 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 295 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  32.79 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 299 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  34.93 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  33.99 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2805  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.011133  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  33 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  33.33 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8768  putative hydrolase  40.87 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 284 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  28.89 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2218  hydrolase, alpha/beta fold family  37.37 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.364835  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7313  Alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3987  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.38084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3651  putative hydrolase  37.37 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.403227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>