More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0987 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  84.56 
 
 
298 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  50.68 
 
 
295 aa  291  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  43.25 
 
 
299 aa  237  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
307 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  44.33 
 
 
308 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
290 aa  211  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
290 aa  171  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  38.69 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  35.42 
 
 
307 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  38.01 
 
 
290 aa  161  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 
282 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  38.91 
 
 
275 aa  155  8e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  37.54 
 
 
277 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 
274 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  38.81 
 
 
274 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 
292 aa  143  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  35.29 
 
 
274 aa  138  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  34.48 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  33.01 
 
 
306 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
286 aa  124  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  34.22 
 
 
284 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  33.33 
 
 
285 aa  120  3e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 
300 aa  120  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  33.58 
 
 
296 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  36.24 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  31.97 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  34.8 
 
 
298 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
319 aa  112  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
297 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 
298 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  29.28 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
298 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
298 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 
298 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 
292 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  29.28 
 
 
300 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 
298 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  28.03 
 
 
284 aa  105  6e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  32.65 
 
 
304 aa  106  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  31.28 
 
 
323 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
283 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  33.99 
 
 
311 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
302 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
311 aa  103  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  32.51 
 
 
289 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
289 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
306 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
302 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  34.02 
 
 
325 aa  99.4  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  34.02 
 
 
378 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  34.02 
 
 
448 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  34.02 
 
 
448 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  33.74 
 
 
421 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
294 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  27.31 
 
 
283 aa  98.6  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  34.02 
 
 
448 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  34.02 
 
 
448 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  33.61 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  32.31 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
330 aa  96.3  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  32.36 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  27.76 
 
 
607 aa  91.3  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  33.96 
 
 
297 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  27.02 
 
 
626 aa  85.1  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  26.28 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
312 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
295 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 
278 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
300 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  26.34 
 
 
255 aa  62.4  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  25.93 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32 
 
 
265 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
294 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5218  alpha/beta hydrolase fold protein  23.9 
 
 
314 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506576  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  25.93 
 
 
255 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
250 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
285 aa  57.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
299 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0307  alpha/beta hydrolase  25.09 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.268135  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 
290 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
280 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  25.1 
 
 
260 aa  56.2  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5402  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 
270 aa  55.8  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>