More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1140 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  84.56 
 
 		 298 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  50.68 
 
 		 295 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  45.96 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  42.01 
 
 		 290 aa  216  4e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  44.89 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 290 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  35.99 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  39.71 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  38.89 
 
 		 275 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  39.48 
 
 		 282 aa  152  8e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  36.68 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  36.75 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  37.27 
 
 		 277 aa  139  7e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  34.4 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.1 
 
 		 285 aa  116  6e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  36.48 
 
 		 286 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 284 aa  112  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  33.97 
 
 		 300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  34.65 
 
 		 298 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  32.25 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  28.62 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  32.24 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  30.8 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  30.8 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  32.67 
 
 		 299 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  34.14 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  34.22 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  32.93 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 		 311 aa  100  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  34.26 
 
 		 311 aa  99.8  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 292 aa  99  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  30.45 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  28.86 
 
 		 283 aa  98.6  1e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 448 aa  97.1  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 302 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  28.69 
 
 		 283 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 378 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 325 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 421 aa  96.3  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 448 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 448 aa  96.3  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  32.85 
 
 		 448 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 304 aa  95.5  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 289 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  32.48 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  31.28 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 		 312 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  28.74 
 
 		 607 aa  92.8  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 309 aa  92  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  28.74 
 
 		 626 aa  90.9  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 293 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  32.93 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  28.09 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 299 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  29.13 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  25.2 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  38.89 
 
 		 250 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  24.8 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 		 250 aa  60.1  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  24.8 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  24.1 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  25.2 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  29.95 
 
 		 294 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  38.32 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  26.12 
 
 		 311 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  23.81 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>