More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2423 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 295 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  70.32 
 
 		 292 aa  419  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  70.32 
 
 		 292 aa  417  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  69.89 
 
 		 302 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 		 286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  40.73 
 
 		 284 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  40.36 
 
 		 300 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  38.59 
 
 		 312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  39.85 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  39.03 
 
 		 297 aa  165  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  38.25 
 
 		 296 aa  161  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  39.26 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  33.93 
 
 		 300 aa  155  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  33.21 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 294 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  36 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  39.57 
 
 		 279 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  33.88 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  33.89 
 
 		 306 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  34.67 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 		 283 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  34.89 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  32.43 
 
 		 304 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  35.77 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  31.91 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 293 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  32.88 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  27.5 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  31.41 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 325 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 448 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 421 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 448 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 378 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  33.09 
 
 		 448 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 607 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  32.73 
 
 		 448 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  27.37 
 
 		 283 aa  120  3e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  31.25 
 
 		 626 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 274 aa  116  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  33.21 
 
 		 274 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  32.57 
 
 		 275 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  28.89 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  31.9 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  32.08 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 292 aa  99.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  31.64 
 
 		 274 aa  99.4  6e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  31.03 
 
 		 284 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  30.04 
 
 		 277 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1337  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.432487  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.63 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 		 363 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1365  alpha/beta hydrolase  27.63 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  36.62 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  31.98 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3711  alpha/beta hydrolase fold  27.42 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  0.241762 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3165  alpha/beta hydrolase fold  29.88 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.358272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.35 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4425  esterase V  31.72 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  24.12 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>