More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1898 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  67.46 
 
 		 296 aa  397  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  60.33 
 
 		 311 aa  340  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  59.15 
 
 		 323 aa  335  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  57 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  59.34 
 
 		 311 aa  333  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  58 
 
 		 299 aa  328  8e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  56.79 
 
 		 294 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  57.05 
 
 		 306 aa  325  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  54.26 
 
 		 319 aa  321  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  55.59 
 
 		 298 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  55.24 
 
 		 297 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  56.14 
 
 		 298 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  55.94 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  55.94 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  55.94 
 
 		 298 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  54.46 
 
 		 335 aa  312  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  58.45 
 
 		 289 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  54.72 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  58.45 
 
 		 289 aa  309  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  57.44 
 
 		 292 aa  307  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  53.5 
 
 		 298 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  57.34 
 
 		 293 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  51.24 
 
 		 306 aa  297  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  54.67 
 
 		 323 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  52.65 
 
 		 284 aa  288  8e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  50.88 
 
 		 304 aa  288  9e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  54.77 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  53.36 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  53.36 
 
 		 378 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  44.6 
 
 		 626 aa  280  3e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  53.36 
 
 		 421 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  53.36 
 
 		 448 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  53.36 
 
 		 448 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  53.36 
 
 		 448 aa  278  8e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  53 
 
 		 448 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  44.25 
 
 		 607 aa  271  9e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  45.94 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  50.53 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  46.5 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  48.29 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 283 aa  212  7e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  45.52 
 
 		 279 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  44.16 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  44.16 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  36.43 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  35.84 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  28.46 
 
 		 284 aa  181  9.000000000000001e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  29.37 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  38.57 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  38.03 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  37.28 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.1 
 
 		 285 aa  153  4e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  38.37 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  37.26 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.78 
 
 		 274 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  39.11 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 290 aa  133  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  36.52 
 
 		 275 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  38.21 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  32.18 
 
 		 305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  33.33 
 
 		 274 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  34.1 
 
 		 277 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 		 300 aa  92.8  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  31.38 
 
 		 285 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4507  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 289 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1862  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308971  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 		 299 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  31.93 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  29.3 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3026  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.4 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4878  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345435  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000359899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  23.22 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>