246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1587 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
330 aa  660    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  66.23 
 
 
311 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  63.29 
 
 
335 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  64.94 
 
 
311 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  62.38 
 
 
306 aa  384  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  60.83 
 
 
299 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  64.71 
 
 
292 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  58.39 
 
 
309 aa  362  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  55.29 
 
 
319 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  56.27 
 
 
296 aa  311  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  53.68 
 
 
323 aa  295  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  54.72 
 
 
300 aa  292  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  50.16 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  49.67 
 
 
289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  49.35 
 
 
298 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  49.02 
 
 
289 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 
297 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  48.36 
 
 
298 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  47.54 
 
 
304 aa  263  4e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  45.75 
 
 
306 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  49.68 
 
 
323 aa  260  2e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  47.44 
 
 
293 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
298 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
298 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  46.71 
 
 
298 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  45.45 
 
 
298 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  44.29 
 
 
287 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  50.35 
 
 
325 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  49.65 
 
 
448 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  45.1 
 
 
304 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  49.65 
 
 
448 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  50.35 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  50.35 
 
 
421 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  49.65 
 
 
448 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  45.72 
 
 
284 aa  238  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  49.3 
 
 
448 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  41.33 
 
 
626 aa  238  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  51.06 
 
 
301 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  49.29 
 
 
302 aa  235  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  42.11 
 
 
607 aa  229  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  45.74 
 
 
312 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 
286 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 
283 aa  206  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  43.4 
 
 
279 aa  196  6e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  31.88 
 
 
284 aa  182  6e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  42.41 
 
 
292 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  34.68 
 
 
300 aa  175  8e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  30.14 
 
 
283 aa  175  8e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  42.07 
 
 
292 aa  175  9e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  35.09 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  42.31 
 
 
295 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
302 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  32.75 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  39.92 
 
 
274 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 
274 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  35.49 
 
 
284 aa  129  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
292 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  35.25 
 
 
297 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 
290 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  31.75 
 
 
305 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
290 aa  119  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  34.94 
 
 
290 aa  119  9e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  34.21 
 
 
307 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 
290 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  36.71 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  32.44 
 
 
299 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  35.47 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  31.77 
 
 
295 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  29.31 
 
 
308 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  32.58 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
307 aa  95.5  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  30.59 
 
 
298 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  32.47 
 
 
277 aa  85.9  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4592  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
296 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3907  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5259  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.956924  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  27.07 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0315  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
300 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  35.43 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  27.87 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 
270 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
303 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
273 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
271 aa  63.5  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  34.21 
 
 
265 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
270 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  24.29 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
285 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131767  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3063  alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.41057  normal  0.789243 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4622  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
299 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.772942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 
266 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>