More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1013 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1013  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
307 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1872  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0521053  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0987  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
298 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.201557  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1140  alpha/beta hydrolase fold protein  46.13 
 
 
298 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.348769  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2860  alpha/beta hydrolase fold  41.32 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.390288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0851  alpha/beta hydrolase fold protein  46.69 
 
 
308 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1659  alpha/beta hydrolase  43.64 
 
 
277 aa  192  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0254328  normal  0.757582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1430  hypothetical protein  40.43 
 
 
295 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.227801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  43.55 
 
 
290 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0361  alpha/beta hydrolase fold  40.56 
 
 
290 aa  172  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0941  alpha/beta hydrolase  41.67 
 
 
284 aa  160  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2701  putative hydrolase / acyltransferase  38.63 
 
 
274 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0927  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.111106 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2253  hydrolase or acyltransferase  37.59 
 
 
274 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1652  hydrolase or acyltransferase  37.45 
 
 
275 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.710733  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0774  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 
307 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.921601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1245  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
290 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.433154 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2058  alpha/beta hydrolase fold  37.94 
 
 
292 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2243  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
274 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.134722  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3569  alpha/beta hydrolase fold  34.39 
 
 
282 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0939994  normal  0.0434942 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2831  Alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
284 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.871853  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1991  alpha/beta hydrolase fold protein  34.08 
 
 
323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.534257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0785  alpha/beta hydrolase fold  36.06 
 
 
302 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2586  alpha/beta hydrolase fold protein  34.56 
 
 
319 aa  122  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0132974  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1573  hypothetical protein  37.22 
 
 
323 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1838  Alpha/beta hydrolase fold  37.92 
 
 
286 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.557547  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1272  Alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
294 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0871  alpha/beta fold family hydrolase  29.45 
 
 
285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0195486  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2070  alpha/beta hydrolase  34.42 
 
 
299 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.169747  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1577  putative hydrolase protein  36.36 
 
 
296 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1650  alpha/beta hydrolase fold protein  36.98 
 
 
289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.133919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1561  alpha/beta hydrolase fold protein  34.52 
 
 
306 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1898  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
300 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.033526 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1707  alpha/beta fold family hydrolase  37.22 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1100  alpha/beta fold family hydrolase  37.22 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.474494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1885  alpha/beta fold family hydrolase  37.22 
 
 
448 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0841527  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1544  alpha/beta fold family hydrolase  37.22 
 
 
448 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0206  alpha/beta fold family hydrolase  37.22 
 
 
378 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218372  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0958  alpha/beta fold family hydrolase  37.22 
 
 
448 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.200305  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3150  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
311 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819995 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1980  alpha/beta hydrolase fold  36.6 
 
 
289 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1731  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 
448 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.722872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2599  alpha/beta fold family hydrolase  36.76 
 
 
301 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.911313  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1782  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 
298 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1396  alpha/beta hydrolase fold  33.72 
 
 
298 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340628  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1356  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
297 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2759  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
304 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2497  alpha/beta hydrolase fold protein  35.87 
 
 
311 aa  105  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0221  putative hydrolase  28.35 
 
 
284 aa  105  9e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.555704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1368  putative hydrolase  33.46 
 
 
304 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4612  Alpha/beta hydrolase  34.35 
 
 
298 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00157572  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1867  hypothetical protein  29.68 
 
 
300 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1012  cation diffusion facilitator family transporter  31.75 
 
 
607 aa  103  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0065  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
312 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418354  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1449  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00111957  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0989  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.160444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1471  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
298 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1876  hypothetical protein  29.33 
 
 
300 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0827  cation diffusion facilitator family transporter  30.59 
 
 
626 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1157  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
293 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0750914  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0785  Alpha/beta hydrolase  27.72 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1587  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
330 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.14015  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2538  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0035  hypothetical protein  32.73 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4365  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.127883 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1646  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
292 aa  88.2  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.969824  normal  0.0462381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4162  alpha/beta hydrolase fold  26.27 
 
 
283 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.685661  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2058  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0070331  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2557  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 
302 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2855  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521635  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2704  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
309 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0111794  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0946  alpha/beta hydrolase  30.95 
 
 
297 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.649137  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2423  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01917  putative hydrolase protein  29.63 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.602694  normal  0.0615168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2766  non-heme peroxidase  29.89 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  28.99 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  31.28 
 
 
299 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4320  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.194736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2096  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.52093  normal  0.167785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4090  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0153093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4166  alpha/beta hydrolase fold  27.09 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
280 aa  64.7  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
260 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4609  alpha/beta hydrolase fold  26.43 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.235001  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
260 aa  60.1  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11146  peroxidase bpoB (non-haem peroxidase)  26.99 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.354208  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  32.2 
 
 
265 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
431 aa  56.6  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3221  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3283  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.115306  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3232  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 
303 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118412  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5586  alpha/beta hydrolase fold  29.57 
 
 
326 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3427  alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
304 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.16542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  28.46 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>