More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1025 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
301 aa  591  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  40.41 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  43.51 
 
 
291 aa  187  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  44.76 
 
 
299 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4995  alpha/beta hydrolase fold protein  41.41 
 
 
308 aa  171  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2616  alpha/beta hydrolase fold protein  43.71 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  37.65 
 
 
290 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  39 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
266 aa  79  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  37.33 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  42.16 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3881  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.909678  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2134  alpha/beta hydrolase fold  37.01 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.470034  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 
264 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 
294 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  23.14 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 
254 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
305 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 
254 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  30.29 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.06 
 
 
2762 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  41.41 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4943  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0186  alpha/beta hydrolase fold protein  42.2 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3289  alpha/beta hydrolase fold  35.43 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.931458  normal  0.0266601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  28.78 
 
 
571 aa  68.2  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
255 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 
265 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  36.89 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0925  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.497533  normal  0.160334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5234  putative hydrolase  35.38 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.373086  normal  0.217404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  30.67 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3146  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0833995  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  24.8 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
273 aa  65.5  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0074  alpha/beta hydrolase fold protein  32.19 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204649 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  32.58 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1812  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0465722  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  38.02 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1731  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 
251 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0799  KR domain protein  34.43 
 
 
3045 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.482882 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5072  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.157677 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2178  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 
250 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  45.1 
 
 
229 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  39.22 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  40.65 
 
 
265 aa  63.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0507  alpha/beta hydrolase fold protein  31.76 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837518  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  33.88 
 
 
510 aa  63.5  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
276 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  35.03 
 
 
250 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13227  lipase lipV  41.51 
 
 
261 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  37.25 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3736  alpha/beta hydrolase fold  36.54 
 
 
284 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5718  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 
330 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  40.2 
 
 
331 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5719  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  32.99 
 
 
283 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1567  chloride peroxidase  34.62 
 
 
274 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  38.26 
 
 
300 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4164  alpha/beta fold family hydrolase  35.58 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3489  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2314  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
270 aa  62.8  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75454  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  35.51 
 
 
326 aa  62.8  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 
248 aa  62.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1703  alpha/beta hydrolase fold  35.58 
 
 
284 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198775  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1653  chloride peroxidase  29.14 
 
 
277 aa  62.4  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
276 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
276 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4415  Alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 
295 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
258 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1567  alpha/beta hydrolase fold  35.67 
 
 
261 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.151157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2627  alpha/beta hydrolase fold protein  37.37 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2027  Alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.56393  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4621  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5340  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24896  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  41.24 
 
 
309 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1844  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719774  normal  0.0141832 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5429  alpha/beta hydrolase fold  36.8 
 
 
254 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814737  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>