More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2404 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
301 aa  606  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  47.68 
 
 
258 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0728  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000117195  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.93 
 
 
271 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.05 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  29.46 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  43.14 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  23.58 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  23.58 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  30.16 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  27.09 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 
267 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1131  bioH protein  29.72 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  27.87 
 
 
275 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  29.92 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  40.38 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1763  alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 
282 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.079054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.44 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  26.09 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  22.76 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  37.27 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2216  alpha/beta fold family hydrolase  40.21 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.111084  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  39.58 
 
 
287 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  38.18 
 
 
340 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.68 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  37.27 
 
 
340 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  39.22 
 
 
361 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  30.12 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  28.79 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.74 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  23.38 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  30.95 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  39.6 
 
 
456 aa  70.1  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.69 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.24 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2011  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  26.15 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 
267 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 
279 aa  68.9  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.35 
 
 
266 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
272 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  22.61 
 
 
262 aa  68.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
263 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  33.94 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4122  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  26.38 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3143  alpha/beta hydrolase fold protein  39.13 
 
 
265 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5163  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365318  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 
296 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  35.24 
 
 
271 aa  67  0.0000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  25.79 
 
 
255 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  39.22 
 
 
264 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  33.06 
 
 
571 aa  67  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  41.67 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  26.27 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2479  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  41.67 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  41.67 
 
 
304 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2287  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  29.65 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  26.97 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1941  alpha/beta hydrolase fold  29.09 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0494053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  33.66 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
350 aa  65.9  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5471  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2922  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  25.4 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
290 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  24.4 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000309374  hitchhiker  0.000000000781643 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>