More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4995 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4995  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 308 aa  588  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0079  alpha/beta hydrolase superfamily protein  48.01 
 
 		 291 aa  239  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0196412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0043  alpha/beta hydrolase fold protein  48.26 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0261008  normal  0.0287829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  45.14 
 
 		 295 aa  209  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  41.81 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2616  alpha/beta hydrolase fold protein  45.24 
 
 		 287 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0515  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2742  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2698  alpha/beta hydrolase fold  38.38 
 
 		 306 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.705965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2728  alpha/beta hydrolase fold  39.57 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.629642  normal  0.292016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  37.61 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0363  Alpha/beta hydrolase fold  34.19 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.176486  unclonable  0.0000000552802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  48.18 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  38.35 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.98 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  36.42 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  40.95 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5003  hypothetical protein  41.38 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.219261  hitchhiker  0.00420621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2055  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011604 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3230  Alpha/beta hydrolase fold  30.57 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.95582  normal  0.900687 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  47.19 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2186  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0437  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.885291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2571  alpha/beta fold family hydrolase  36.84 
 
 		 349 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1900  alpha/beta fold family hydrolase  36.64 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1835  alpha/beta hydrolase fold  41.9 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0596048 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3775  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.94 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1825  alpha/beta hydrolase fold  36.21 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388616  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  33.71 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  39.05 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3929  alpha/beta hydrolase fold  37.14 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.419283  decreased coverage  0.00575896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0736  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1098  Alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  35.07 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  27.22 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0222  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 308 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.267301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 		 254 aa  57  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  40.32 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  36.84 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  39.53 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10140  alpha/beta hydrolase  41.13 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0243415  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  38.05 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2628  non-heme peroxidase, putative  39.47 
 
 		 273 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1579  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2554  alpha/beta hydrolase fold  35.34 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000366635  normal  0.152292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  34.83 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5407  Alpha/beta hydrolase  34.85 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.632759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4707  alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1579  putative hydrolase  35.34 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144323  normal  0.811141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2119  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0124464 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 		 280 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1555  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1525  alpha/beta hydrolase fold  43.4 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0190867  normal  0.846778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 275 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  32.3 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.23 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3005  Alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0579  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5976  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  41.11 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1498  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2138  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1058  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2101  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.19 
 
 		 2762 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  37.11 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  30.94 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>