More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4252 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 300 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  32.53 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 300 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  36.04 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  31.97 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  36.19 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  27.52 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  36.19 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 285 aa  94  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  30.88 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.96 
 
 		 292 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4916  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 277 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.503338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  38.35 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  26.23 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2400  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.53 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6816  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 333 aa  72.4  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  25.73 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6488  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6723  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0978  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.076368 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 		 314 aa  69.3  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1592  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121533  normal  0.0764642 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.444129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6666  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203299  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0691  alpha/beta hydrolase  24.43 
 
 		 290 aa  67  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.363782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0389  alpha/beta hydrolase fold  26.37 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.362666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 		 280 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  26.13 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  32.04 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  43.3 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0558  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  24.57 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 274 aa  65.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.94 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  31.11 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2483  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2122  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237751 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0493  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.5355  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.33 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0509  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 		 602 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1692  alpha/beta hydrolase fold protein  34.03 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155751 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  23.68 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  32.43 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  32.43 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  34.81 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.76 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  32.35 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  40.38 
 
 		 291 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  32.43 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  30.43 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21050  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2250  alpha/beta hydrolase fold protein  33.06 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000261715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.21 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  26.3 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  25.98 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1173  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.95564  decreased coverage  0.000000135804 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1459  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1808  hypothetical protein  32.11 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3131  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  25.76 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2625  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.738195  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2704  alpha/beta fold family hydrolase  29.95 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1628  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.989142  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1384  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  24.28 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  23.91 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1684  alpha/beta fold family hydrolase  31.03 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.163104  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  24.14 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3478  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  37.04 
 
 		 387 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>