More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1534 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.85 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 		 299 aa  92.8  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 		 296 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  26.21 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4252  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.733578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  28.72 
 
 		 292 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  27.03 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3552  alpha/beta hydrolase fold protein  26.42 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336946  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  29.84 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  26.35 
 
 		 320 aa  79.7  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  28.35 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  24.34 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  28.27 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 290 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 261 aa  72  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  26.14 
 
 		 287 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  25.76 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  28.09 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 267 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  24.9 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  27.69 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  23.91 
 
 		 292 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  28.08 
 
 		 275 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  23.95 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  27.31 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  29.9 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  27.31 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  27.31 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  27.97 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  27.31 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  29.9 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  23.67 
 
 		 294 aa  67  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  26.22 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  23.34 
 
 		 279 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  27.59 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  23.57 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  26.74 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  26.74 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.18 
 
 		 387 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  25.57 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  26.2 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  25.68 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  21.68 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  24.22 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  23.33 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  24.81 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.46 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  25.1 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  24.57 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  23.83 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  23.26 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  23.05 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6254  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.140494  normal  0.235201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  26.05 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  22.99 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  27.6 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1647  alpha/beta hydrolase fold protein  24.29 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07460  lysophospholipase  25.47 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0863462 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  23.53 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  25.83 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  25.72 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  22.51 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1899  alpha/beta hydrolase fold protein  24.1 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  26.63 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  24.3 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  23.68 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  25.49 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  21.54 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  23.46 
 
 		 270 aa  56.2  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  23.36 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.343862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>