171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1074 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1074  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
271 aa  557  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.722843  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1154  alpha/beta hydrolase fold  98.89 
 
 
271 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.269729  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2045  alpha/beta hydrolase fold  75.94 
 
 
275 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2272  alpha/beta hydrolase fold  69.47 
 
 
286 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0854176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1830  alpha/beta hydrolase  68.89 
 
 
270 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1357  hypothetical protein  65.33 
 
 
283 aa  362  2e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0861154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3339  hypothetical protein  62.59 
 
 
289 aa  353  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3591  hypothetical protein  65.28 
 
 
269 aa  352  5e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2844  hypothetical protein  56.44 
 
 
280 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1160  hypothetical protein  50.19 
 
 
309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485022 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5967  hypothetical protein  49.81 
 
 
281 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.895466  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2128  hypothetical protein  50.19 
 
 
281 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00833807  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2580  hypothetical protein  49.62 
 
 
275 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2110  hypothetical protein  49.81 
 
 
281 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0833306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5416  hypothetical protein  49.62 
 
 
281 aa  251  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539112  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1692  hypothetical protein  49.23 
 
 
275 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.959069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2196  hypothetical protein  49.23 
 
 
275 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.446951  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3122  hypothetical protein  49.23 
 
 
275 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.798487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1469  hypothetical protein  49.23 
 
 
275 aa  250  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.816074  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2714  hydrolase  48.5 
 
 
275 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2635  hypothetical protein  48.5 
 
 
275 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348998  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1891  hypothetical protein  49.23 
 
 
275 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2020  hypothetical protein  49.25 
 
 
281 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0898087 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2147  hypothetical protein  49.25 
 
 
281 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0977369  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1570  putative hydrolase  49.06 
 
 
267 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2563  alpha/beta hydrolase fold  49.06 
 
 
267 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.19966  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1064  alpha/beta hydrolase fold protein  46.72 
 
 
273 aa  232  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456045  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1442  alpha/beta hydrolase fold protein  48.12 
 
 
264 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0968  putative hydrolase protein  45.95 
 
 
273 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1087  alpha/beta fold hydrolase  47.29 
 
 
268 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1125  putative hydrolase protein  45.17 
 
 
273 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.460343  normal  0.235814 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1051  alpha/beta hydrolase fold  44.06 
 
 
273 aa  218  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380491  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1692  hypothetical protein  34.9 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1691  hypothetical protein  34.51 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2047  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 
261 aa  170  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.939702  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43550  putative hydrolase  36.26 
 
 
270 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02422  acyltransferase 3  33.07 
 
 
267 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4203  Alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 
268 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.510687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4105  hypothetical protein  32.18 
 
 
301 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.710482  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2217  hypothetical protein  35.66 
 
 
269 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3652  putative hydrolase  34.81 
 
 
270 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.681326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2026  hypothetical protein  33.98 
 
 
269 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.852935  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3737  alpha/beta fold family hydrolase  35.8 
 
 
262 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3490  alpha/beta fold family hydrolase  35.41 
 
 
262 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2933  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
279 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0612634  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1702  hypothetical protein  35.41 
 
 
287 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351534  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4165  hypothetical protein  35.02 
 
 
287 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2460  alpha/beta hydrolase fold  35.32 
 
 
267 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0787  hydrolase  30.63 
 
 
296 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0793  putative hydrolase  30.63 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1736  hypothetical protein  31.48 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000795767  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0252  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2106  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 
292 aa  89.4  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2013  alpha/beta hydrolase fold protein  25.37 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.096927  hitchhiker  0.0025286 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1872  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
292 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2333  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2450  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0479  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1750  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.99004  normal  0.411662 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03661  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12320)  31.58 
 
 
444 aa  75.9  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.843085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4240  alpha/beta hydrolase fold  22.73 
 
 
296 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.033675  hitchhiker  0.000000334465 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0758  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.252363  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
279 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6315  hypothetical protein  26.42 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1365  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.371007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1534  alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0162186  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0089  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2358  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52126  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72750  hypothetical protein  25.38 
 
 
292 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118117  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2542  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4532  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
292 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2705  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.149803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0430  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
300 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3404  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
290 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.375307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  24.51 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1673  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
296 aa  59.3  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478799  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0998  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 
303 aa  59.3  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.461316  hitchhiker  0.000000131083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1678  alpha/beta hydrolase fold protein  24.53 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0849008  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86220  predicted protein  26.09 
 
 
320 aa  56.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  35.81 
 
 
254 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0107  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 
315 aa  55.8  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0430682  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5281  alpha/beta hydrolase  30.19 
 
 
272 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2452  alpha/beta hydrolase fold  22.39 
 
 
290 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0592  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
300 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0880  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
296 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375408  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
315 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  25.45 
 
 
429 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  22.78 
 
 
332 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1033  alpha/beta hydrolase fold  28.82 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  25.25 
 
 
333 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08025  toxin biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01450)  25.41 
 
 
418 aa  50.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0687285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0888  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109453  normal  0.281853 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
299 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
297 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  23.88 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2728  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
271 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190242  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  24.74 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
332 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>